Única sobrevivente do combate contra o letal "alien", a tenente Ripley (Sygourney Weaver) regressa ao planeta onde tudo começara, julgando que se trata de dizimar aquela espécie, quando se trata de um projecto militar para estudar o "alien" como arma. Tudo foge ao controle e Ripley vai ter de novo que enfrentar o seu terrível adversário.